DOI: 10.35411/2076-457X-2024-3-13-20
Disinfection Affairs № 3/2024, pp. 13-20
The effectiveness of the use of disinfectants and specialized agents for the degradation of nucleic acid amplification products on laboratory surfaces
T.L. Zamotaeva, S.S. Trofimova, O.A. Abrosimova, E.A. Cherkashin, V.G. Akimkin
Federal Budgetary Institution of Science Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor: 111123, Russian Federation, Moscow, Novogireevskaya str., 3a.
The rapid development of the PCR method opens up new opportunities for science and diagnostics. At the same time, the steady increase in the number of studies conducted increases the risk of contamination and, as a consequence, false-positive results. Today there are many ways to solve this problem, but none of them is universal. This paper presents the results of a comparison of the use of disinfectants and special decontamination agents to eliminate contamination of laboratory surfaces with nucleic acid amplification products – PCR amplicons. Study of decontamination activity against short DNA fragments of 117 bp were carried out under conditions that most closely simulate contamination of laboratory surfaces with PCR products. The effectiveness of decontamination was assessed by the residual number of amplicons in swabs from working surfaces. The high efficiency of destruction of amplicons when treating plastic, glass and metal surfaces with special decontamination agents based on metal ions and disinfectants based on oxygen-containing compounds has been shown. At the same time, it has been shown that agents containing a peroxide radical are capable of destroying amplicons mainly in combination with UV irradiation. Based on the results obtained, the feasibility of using metal ion-based decontamination agents for rapid and effective surface treatment in laboratories using nucleic acid amplification methods was demonstrated.
Keywords: disinfectants, PCR, amplicons, decontamination.
Authors
Tatyana L. Zamotaeva – Researcher at the Center for Product Development and Innovation of the Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor. ORCID ID: 0009-0003-9799-3749. Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript., tel.: + 7(495) 974-96-46, ext.3831
Svetlana S. Trofimova – Technologist-Developer of the Center for Product Development and Innovation of the Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor. ORCID ID: 0009-0009-3717-2870
Olga A. Abrosimova – Epidemiologist, Head of the Epidemiological Service of the Federal Budgetary Institution of Science Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor. ORCID ID: 0000-0002-4545-1804
Evgeniy A. Cherkashin – Ph.D., Head of the Center for Product Development and Innovation of the Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor. ORCID ID: 0000-0002-3627-6047
Vasily G. Akimkin – Doctor of Medical Sciences, Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences, Director of the of the Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor; ORCID ID: 0000-0003-4228-9044
Full-text is available in Russian
DOI: 10.35411/2076-457X-2024-3-13-20
Дезинфекционное дело № 3/2024, стр. 13-20
Эффективность применения дезинфицирующих средств и специализированных средств для деградации продуктов амплификации нуклеиновых кислот на лабораторных поверхностях
Т.Л. Замотаева, С.С. Трофимова, О.А. Абросимова, Е.А. Черкашин, В.Г. Акимкин
ФБУН "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека: 111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а.
Стремительное развитие метода ПЦР открывает новые возможности для науки и диагностики. Вместе с тем, неуклонный рост количества проводимых исследований повышает риск возникновения контаминации и, как следствие, появления ложноположительных результатов. Сегодня существует множество способов решения этой проблемы, однако ни один из них не является универсальным. В данной работе представлены результаты сравнения дезинфицирующих средств и способов, а также специальных деконтаминационных средств для ликвидации контаминации лабораторных поверхностей продуктами амплификации нуклеиновых кислот – ПЦР-ампликонами. Исследование деконтаминирущей активности в отношении коротких фрагментов ДНК размером 117 п. н. проводили в условиях, наиболее близко имитирующих загрязнение поверхностей лаборатории продуктами ПЦР. Эффективность деконтаминации оценивали по остаточному количеству ампликонов в смывах с рабочих поверхностей. Показана высокая эффективность разрушения ампликонов при обработке пластиковых, стеклянных и металлических поверхностей специальными деконтаминационными средствами на основе меди сернокислой (II) 5- водной и дезинфицирующими средствами на основе кислородсодержащих соединений (2-3 %). Вместе с тем показано, что средства, содержащие пероксид радикал, способны разрушать ампликоны главным образом в комбинации с УФ-облучением. На основании полученных результатов была продемонстрирована целесообразность использования деконтаминационных средств на основе меди сернокислой (II) 5-водной для быстрой и эффективной обработки поверхностей в лабораториях, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот.
Ключевые слова: дезинфицирующие средства, ПЦР, ампликоны, деконтаминация, УФ- облучение.
Сведения об авторах
Замотаева Татьяна Львовна – научный сотрудник Центра разработки, развития продукции и инноваций ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора; служебн. тел.: тел.: (495) 974-96-46, вн.3831, e-mail: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.. ORCID ID: 0009-0003-9799-3749
Трофимова Светлана Сергеевна – технолог-разработчик Центра разработки, развития продукции и инноваций ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. ORCID ID: 0009-0009-3717-2870
Абросимова Ольга Андреевна – врач-эпидемиолог, руководитель Эпидемиологической службы ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. ORCID ID: 0000-0002-4545-1804
Черкашин Евгений Александрович – кандидат химических наук, руководитель Центра разработки, развития продукции и инноваций ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. ORCID ID: 0000-0002-3627-6047
Акимкин Василий Геннадьевич – доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. ORCID ID: 0000-0003-4228-9044